我最近在我的 Win10 64位电脑上安装 RAD Studio 10 Seattle 成功后出现了莫名其妙的问题， 我百度了很久都没解决，直到发现一篇博客试了一试，解决了，我太开心了，觉得还是把这些坑都写清楚，方便大家避坑
原文链接
打开目录之后发现没有machine.config文件
复制 machine.config.default 文件去掉后缀名
之后成功运行RAD Studio 10
RAD Studio 安装之后出现“配置系统未能初始化“
article/2025/7/18 6:32:04
相关文章
莫名其妙的“配置系统未能初始化”异常
最近在讲课演示的时候，偶尔会发生如下的异常。“配置系统未能初始化”，当时也没有时间深究到底什么原因造成的。 今天再一琢磨，以上的InnerException提示说：无法识别的配置节userSettings。 再一深入找下去，我们找到下…
如何解决未能初始化战场服务器,microsoft net framework配置系统未能初始化
怎么解决这个问题？——一开机就跳出来！！！ 有关调用实时(JIT)调试而不是此对话框的详细信息， 请参见此消息的结尾。 ************** 异常文本 ************** System.Configuration.ConfigurationErrorsException: 配置系统未能初始化 ---> System.Configuration.Config…
Error：配置系统未能初始化
Error：配置系统未能初始化
调试自己软件的时候，VS弹出了个提示：应用程序错误：信息配置系统未能初始化 跟踪堆栈的时候，发现所有类序列化失败
最后在C盘AppData找到相关软件相关版本的user.config文件，删…
“配置系统未能初始化” 的异常一种产生原因
今天VS2017造成电脑死机，重启电脑后打开VS进行调试发现程序启动失败，原因是读取Settings配置信息时产生“配置系统未能初始化”异常，但是App.config文件并未修改，所以网上的一些解决办法在这里并不适用了，由于C#的配置…
计算生物化学中计算RMSD的方法
vmd 中计算RMSD的方法:(http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/vmd/tutorial-html/node7.html） amber中计算RMSD的方法:（http://ambermd.org/tutorials/analysis/tutorial1/)
gnuplot软件学习笔记
gnuplot，一个命令行交互式的绘图工具
gnuplot学习资料：
gnuplot本身自带的官方使用教程，输入help交互式打开
help
可以找马欢老师的gnuplot中文教程：http://ouc.ai/zhenghaiyong/courses/tutorials/gnuplot/gnuplot-zh.pdf
g…
Nature | 基于深度神经网络和改进的片段测序方法从头预测蛋白质结构
Nature子刊 Machine Intelligence发布了八月份最新接收论文，共4 篇。一篇是清华生命学院龚海鹏和澳大利亚格里菲斯大学周耀旗等人用神经网络进行蛋白质结构预测方面的工作。 DeepMind提出的AlphaFold证明了深度学习能大幅度提高蛋白质结构预测准确度。2019年8月&…
回归分析中的评价方法
回归（Regression）不同于分类问题，在回归方法中我们预测一系列连续的值，在预测完后有个问题是如何评价预测的结果好坏，关于这个问题目前学术界也没有统一的标准。下面是我在论文中的看到的一些常用方法，希望…
AMBER分子动力学简例
AMBER分子动力学简例（一）
概述
以下是使用AMBER包的简单教程，希望对开始学习分子动力学的同学有用处。申明一下，以下教程原版来自网上，是最最基本的教程，同时也非常实用，有非常好的借鉴意义。…
【学习笔记】山东大学生物信息学-04 蛋白质结构预测与分析
课程地址：山东大学生物信息学 文章目录 四、蛋白质结构预测与分析4.1 蛋白质的二级结构4.2 蛋白质的三级结构4.3 三级结构可视化软件 VMD4.4 计算方法预测三级结构4.5 三级结构的比对4.6 蛋白质分子表面性质4.7 获取蛋白质四级结构4.8 蛋白质-蛋白质分子对接4.9 蛋白…
Docking非原生配体
转载于 https://mp.weixin.qq.com/s/VDN1qAZGIMol6prwQW4umw Docking非原生配体 在前面的例子中，AutoDock Vina能把配体构象调整到几乎原生的构象，验证了这一预测方法的准确度。下面，我们尝试docking另外一个配体药物nelfinavir奈非那韦&…
AutoDockFR：具有明确指定结合位点灵活性的蛋白质-配体对接研究进展
微信公众号参考链接:链接 引用原文：Ravindranath, Pradeep Anand et al. “AutoDockFR: Advances in Protein-Ligand Docking with Explicitly Specified Binding Site Flexibility.” PLoS computational biology vol. 11,12 e1004586. 2 Dec. 2015, doi:10.1371/j…
CADD之分子对接二：简单autodockvina对接流程——redocking
1、需要软件：autodocktools，vina，pymol
pymol使用教程(包含安装)：基础教程 — PyMOL中文教程 2022.09 文档
autodocktools及vina安装包：
「autodocktools」https://www.aliyundrive.com/s/88pQFmFBNKK 点击链接保存…
对分子模拟轨迹数据的分析绘图
简介
建立模型进行分子动力学模拟后，对得到的轨迹进行主成分分析（PCA），绘制相关性矩阵（Correlation Matrix）和自由能井图（Free Energy Landscape）和dssp图（Definition …
【学习笔记】ICLR2022-GNNRefine
一、代码Run
1. 运行
python /home/huangjiehui/Project/AIProtein/StructuralReconstruction/RefineGNN/ab_train.py --cdr_type 3 --train_path /home/huangjiehui/Project/AIProtein/StructuralReconstruction/RefineGNN/data/sabdab/hcdr3_cluster/train_data.jsonl --va…
利用pymol批量对PDB文件三维结构比对并输出RMSD值
经验上、文献上大量的蛋白质或者核酸比对工作是从一级序列开始的，这是基于一级序列决定二级结构，二级结构决定三级结构，而且一级序列有30%的相似性，那么两者的结构就具有较高的相似性这样的共识理论而来，这些理论也是基…
AMBER:使用Cpptraj计算RMSD 以及使用中遇到的问题
记录笨比生活又一天 输入文件rms.in设置运行cpptraj遇到的问题1.cpptraj不输出结果2.空格的问题 Tofirst:[空格]1-249&!H firstTofirst[空格]:1-249&!H first 输入文件rms.in设置
parm XXXXX.prmtop #载入拓扑文件
trajin XXXX_prod.nc #载入轨迹文件
rms ToFirst …
分子动力学模拟Amber/Gromacs结合自由能计算 药效团模型构建RMSD、RMSF
文章来源：公众号“科研讨论圈” 以下是使用AMBER、GROMAVCS的教程，希望对开始学习分子动力学的同学有帮助。 分子动力学入门理/论 分子力学简介 分子…
RMSD:通过旋转计算两个分子间的最小rmsd
使用旋转计算两个分子的均方根偏差（RMSD）
使用Kabsch算法（1976）或Quaternion算法（1991）进行旋转，在两个笛卡尔坐标之间.xyz或者.pdb格式中计算均方根偏差（RMSD）…
PSP - TMScore(US-align)、RMSD、Sequence 源码
欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/ 本文地址：https://blog.csdn.net/caroline_wendy/article/details/129125467 参考文档：Nature Methods | 蛋白、RNA、DNA及其复合物结构的比对算法US-align
官网地址：https://zha…