文章来源：公众号“科研讨论圈”
以下是使用AMBER、GROMAVCS的教程，希望对开始学习分子动力学的同学有帮助。
- 分子动力学入门理/论
- 分子力学简介
- 分子力学的基本假设
- 分子力学的主要形式
- 分子力场
- 分子力场的简介
- 分子力场的原理
- 分子力场的分类及应用
LINUX入门 LINUX 简
分子动力学模拟Amber/Gromacs结合自由能计算 药效团模型构建RMSD、RMSF
article/2025/7/18 11:51:19
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PSP - TMScore(US-align)、RMSD、Sequence 源码
欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/ 本文地址：https://blog.csdn.net/caroline_wendy/article/details/129125467 参考文档：Nature Methods | 蛋白、RNA、DNA及其复合物结构的比对算法US-align
官网地址：https://zha…
基于Gromacs的蛋白分子动力学模拟（RMSD、RMSF及蛋白的回旋半径）
一、实验要求
实验对象：目标体系为modeller或其他方法建模的结果中评价最好的模型。
软件： Gromacs-5.1.2
二、实验步骤
加立场
gmx pdb2gmx –h 打开帮助菜单。 选力场的时候选择 Amber99sb…,溶剂类型选Tip3p。
2、加模拟盒子，溶剂层…
RMSD与PMSF 解释与区别
我不需要力量源泉 对我来说 这只是需要完成的一件事，我应该一直全力以赴的做下去 放弃不是我的天性，我甚至不在乎乐观还是悲观。 二者都是对位移的平方和再求平方根，最后求得均值。区别在于：RMSD为在同一帧情况下，对不…
pymol pymol-align两分子或蛋白距离误差计算RMSD；spyrmsd库计算RMSD
参考：https://zhuanlan.zhihu.com/p/347743101 https://www.codenong.com/cs106148400/
RMSD
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装有office2010以上版本功能：批注
一、单个批注
右击显示或隐藏批注 显示表示批注不退出（鼠标移开时）
二、所有批注
审阅显示或隐藏批注
三、…
Excel中批量添加批注图片
excel中想实现这种悬停时显示图片的效果 1、将图片与单元格命名一致，并将图片与excel文件放置在同一目录下 2、选中需要设置的单元格，点击【开发工具】 -查看代码（如果没有开发工具往下看） 3、在编辑框中输入以下代码并运行
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esayExcel自定义注解导出表头批注
注解
package com.baidu.activitidemo.annotation;import com.baidu.activitidemo.handler.ExcelRemarkHandler;import java.lang.annotation.*;/*** 设置表头的批注, 需要配合{link ExcelRemarkHandler}使用** author li* date 2022/09/24*/
Target(ElementType.FIELD)
Reten…
把Excel批注的“红三角”放在单元格左上角_Excel的批注功能，全部知道的不足10%，你会用的仅仅是冰山一角...
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