解决方案(来自微软官网)
不同版本visio与Microsoft办公软件兼容说明
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win10安装Visual Studio 2019失败
小僧最近电脑总安装不上Visual Studio 2019，最后终于装上了，是由于系统版本不兼容。 这里给出两个链接：
VS官网：下载Visual Studio 2019社区版Visual Studio 2019 系统要求：查看VS 2019支持的系统
链接2中截图如下&a…
【经验】win11上安装visio
1、问题描述
在win11上安装一个visio2016时报错，提示：要安装即点即用版本的Visio，或者卸载已经安装的好的office。
安装时的步骤如下： 1）使用WinRAR打开visio安装文件ISO： 双击setup.exe 2）无…
Win10 安装Visio2016和Offic2016安装出现即点即用无法安装问题
环境：
Win10 专业版
Visio2016专业增强版
Offic2016专业增强版
问题描述：
安装Visio2016和Offic2016安装出现即点即用无法安装问题
解决方案：
1.网上改xml文件（未解决）
2.全部卸载，重新下载Office_…
RNA-seq数据分析(HISAT2+featureCounts+StringTie)
RNA-seq数据分析 简介1 生物基础1.1 中心法则1.2 RNA-seq Protocol1.3 RNA-seq总的路线图 2 数据分析2.1 前期准备2.1.1 创建目录&安装conda2.1.2 常用文件格式简介 2.2 软件安装2.2.1 conda安装软件2.2.2 预编译版本软件安装2.2.3 源码安装 2.3 数据下载 下载完成之后一定…
【1】RNA-seq 测序数据之Hisat2比对-featurecount计算-EdgeR分析
一、 拿到测序数据之后，首先选择参考基因组及比对工具进行比对 1、Hisat比对：（6个G的测序数据耗时20分钟，比对率78.4%）##物种差异度大导致比对率低 ##build index
hisat2-build -p 4 Pyrus_bretschneide…
RNA-seq——上游分析练习（数据下载+hisat2+samtools+htseq-count）
步骤 0. 练习前准备1. 找到文章对应的数据集2. 下载数据集3. 与参考基因组进行比对4. reads计数5. 踩过的一点小坑 写在前面——之前使用的数据是单端测序，但是现在的数据基本都是双端测序。所以又找了个双端测序的例子来练习。之前在单端测序数据中，因为…
测序比对软件的总结----hisat2
hisat2的官网的manual： https://github.com/DaehwanKimLab/hisat2/blob/master/MANUAL 在这里记载了详细用法和介绍，此处仅为学习笔记，和实例记录。
HISAT2 is a fast and sensitive alignment program for mapping next-generation sequenc…
【bioinfo】hisat2/bowtie2比对结果summary文件解读
hisat2/bowtie2比对后，比对结果基本信息统计的summary文件解读。
参考：
https://www.cnblogs.com/leezx/p/8540862.htmlseqanswers 论坛上的一个问答
使用seqanswers上的一个结果文件示例： 以及对应的回答： 整理该汇总文件中…
Hisat2 Bowtie2比对结果解读
Bowtie的中文意思是：领结，蝴蝶结 Bowtie2用户手册：
http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/manual.shtml
在看比对结果前需要了解三个概念：
1.Aligned concordantly 合理比对 主要和比对参数：–fr/–rf/–ff 有…
hisat2构建转录组索引的问题
hisat2构建转录组索引的问题 目前最新版为为hisat2. 安装过程如下
wget ftp://ftp.ccb.jhu.edu/pub/infphilo/hisat2/downloads/hisat2-2.1.0-Linux_x86_64.zip unzip hisat2-2.1.0-Linux_x86_64.zip 下载解压缩即可。
在进行比对前，首先需要对参考基因组建立索引…
hisat2比对结果图文解析
hisat2比对结果图文解析 看到hisat2输出的这个比对结果统计信息，是不是有点懵？ 下面用图的方式进行简单剖析： 以上参考自https://blog.csdn.net/weixin_34191845/article/details/86453897
参考文献 Hisat2 bowtie2比对结果解读（…
RNA-seq——三、使用Hisat2进行序列比对
步骤 1. 下载对应的index2. 序列比对3. samtools：将sam文件转为bam文件4. 将bam文件载入IGV 为什么要比对：https://www.jianshu.com/p/681e02e7f9af Jimmy老师主要演示了四种比对工具，分别为hisat2、subjunc、bowtie2、bwa。除了subjunc能够直…
hisat2的index差别
下载的时候发下hisat2 主页中有多个index文件，一时间不解，搜索后发现如下评价。 目录 1.下载三个index：2.重命名为：3.hisat2比对命令：4.比对率：结论 1.下载三个index： 2.重命名为： …
RNA-seq流程学习笔记（7）-使用Hisat2进行序列比对
参考文章： RNAseq(4)–Hisat2进行序列比对及Samtools格式转化 RNA-seq(5):序列比对：Hisat2 hisat2比对软件将reads比对到参考基因组 hisat2比对 RNA-seq数据分析使用方法（陈建国 译） 转录组分析2——比对基因组 RNA-seq练习 第二部…
RNA-seq分析htseq-count的使用
HTSeq作为一款可以处理高通量数据的python包，由Simon Anders, Paul Theodor Pyl, Wolfgang Huber等人携手推出HTSeq — A Python framework to work with high-throughput sequencing data。自发布以来就备受广大分析人员青睐，其提供了许多功能给那些熟悉python的大佬们去自信…
![转录组学习之序列比对（Hisat2）[学习笔记通俗易懂版]](https://img-blog.csdnimg.cn/e99c9df3c6ca436491401c75aafe334e.png)
转录组学习之序列比对（Hisat2）[学习笔记通俗易懂版]
转录组学习之序列比对（hisat2）[学习笔记通俗易懂版]
data :2023.7.25
recorder :CYH-BI
特别注意：本文为我自己学习的学习记录，没有任何权威，只能仅供初学者提供思路与参考。 本文知乎地址：https://zhua…
Hisat2安装及比对
Hisat2和STAR是目前转录组分析过程中用来做比对的两款主要工具，记得有一篇好像是2017年的文章专门比较了几款转录组比对工具对结果的影响，结论中认为两款软件在实际使用过程中对结果影响及耗时区别不大，我认为选一款就可以，之前总…
Hisat2 比对到参考基因组
比对的流程：建立索引→比对到参考基因组→SAM转BAM文件→BAM建立索引
1.准备参考基因组、建立索引
## 参考基因组准备:注意参考基因组版本信息
# 下载，Ensembl：http://asia.ensembl.org/index.html
# http://ftp.ensembl.org/pub/release-…