RMSD与PMSF 解释与区别

article/2025/8/9 21:48:25

我不需要力量源泉 对我来说 这只是需要完成的一件事,我应该一直全力以赴的做下去 放弃不是我的天性,我甚至不在乎乐观还是悲观。
二者都是对位移的平方和再求平方根,最后求得均值。区别在于:RMSD为在同一帧情况下,对不同原子对选定原子的偏差均值;RMFD为同一原子情况下,对不同帧数时原子的偏差均值。

RMSD:Root Mean Square Deviation 均方根偏差

在这里插入图片描述
δ i \delta_i δi为某一帧的第i个原子的位置减去参考构象中它的位置(位置偏移量),然后取所有原子的偏移量的平方和,再对原子数N取平均,再开方。
*其中RMSD倾向于在七自由度约束使用。 *

RMSF:Root Mean Square Fluctuation 均方根波动

在这里插入图片描述
引入T,与时间有关。根号内项:t时刻某个原子的位置,减去初始时刻它的位置(位置偏移量),再对所取的偏移量的平方和,再对时间平均,开根号。


http://chatgpt.dhexx.cn/article/BCpfsPcP.shtml

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