利用Mimics.19对肺支气管进行三维重构

article/2025/10/12 1:13:00

MIMICS是Materialise's interactive medical image control system的缩写,是Materialise公司发明的一种医学影像控制系统,是模块化结构的软件,可以根据用户的不同需求有不同的搭配。

随着时代的发展,Mimics不仅可以用于医学领域,还可以运用于岩石测绘等结构体的三维重构即由二维图像向三维图像的转换过程。本文章是笔者在对肺部气管及支气管进行三维重构的研究中得出的一些思考。

本文将以Mimics19作为操作软件进行分析,若需要软件安装包或者有疑问请私信交流。

Show/Hide the volume rendering:

从二维图直接生成三维图像,右侧工具栏volume rendering一项内第二个点下拉可以消除软组织图像。

生成三维图像只可观察,不可生成STL文件/导出。

 

Original approach:

  1. 肉眼观察法选择阈值,手动擦除外层皮肤及其他组织。
  2. 气管被肺部包围,外层皮肤难以祛除,难以看清气管结构。

 

Final approach:

  1. Segment->Pulmonary->Segment Airway:(主视图)在气管顶端空腔划线(从上向下方向),系统自动生成主干对应空间,退出全屏,选择Calculate 3D,自动生成主干部分3D模型。
  2. Segment->Muscular->New mask:新建Mask,选择阈值:-161~1357,Segment->Muscular->Split mask,Region A 圈涂出支气管所在区域,Region B与Region A紧邻并1包裹Region A,每隔2-3帧圈涂一次(从气管恰出现对应的帧开始,至气管消失的帧结束),结束后选择Region A对应Mask,点击Calculate 3D,生成相应一侧的支气管。在转向另一侧操作时,需要再次New Mask,随后操作与之前相同。

 

3、File->Export->Binary STL ->3D->choose items->add->apply:生成并导出STL文件。(建议以日期_序号命名文件,并将文件存放于对应文件夹下)

(succeed)

后注:

对此文章讨论做法来说,会生成4个STL文件,笔者为了便于管理,将这四个STL文件放置在同一个文件夹中并打成压缩包形式进行保存。

笔者不才,最后得到的三维图形中有一些离散的数据集合,即游离于整体器官部分之外的值,若读者朋友对此有改善方法或者其他更好的做法欢迎留言评论或者私信笔者。

笔者做法与下面链接视频中的做法较为类似但又有所区别,读者朋友们可以按照自身需求各取所需。

笔者还参考了知网上的一些论文,如赵兴老师——基于CT影像的肺气管三维重构方法研究,感谢老师们的帮助与启迪。

若需要Mimics.19的操作说明也请私信,让我们共同进步!

Reference:

Video:

 https://haokan.baidu.com/v?pd=wisenatural&vid=213763978867608480


http://chatgpt.dhexx.cn/article/yy1pKpnA.shtml

相关文章

医学有限元(Mimics、ANSYS)

一,医学有限元(Mimics、ANSYS) 3月26日—3月29日 在线直播 课程一:有限元法概述及分析(生物力学基础) 有限元建模基础知识培训: 课程二:mimics软件(上机操作案例分析): 医学有限元模型的特点及建…

(Mimics、ANSYS)医学三维重建

一,医学有限元(Mimics、ANSYS) 3月26日—3月29日 在线直播 课程一:有限元法概述及分析(生物力学基础) 有限元建模基础知识培训: 课程二:mimics软件(上机操作案例分析): 医学有限元模型的特点及建…

VTKmimics Calculate Parts

前言:本博文主要研究mimics中Calculate Parts所采用的方法以及VTK中三维重建的方法,希望对各位小伙伴有所帮助,谢谢! mimics-Calculate parts - Interpolation Gray Interpolation 灰度值插值是一种真正的3D插值,它考…

Massive MIMO

什么是MIMO?从SISO到MIMO - 华为 (huawei.com) Multiple-Input Multiple-Output,多入多出 概念: 在发送端和接收端都使用多根天线构成多个信道的天线系统,从而在不增加通信带宽的条件下有效提高信道容量(…

基于MIMICS的口腔模型的配准

为什么要配准? 在口腔医学领域,为了能更好的对术后的病人的恢复情况进行了解,需要对术前术后的口腔情况进行对比;目前对于病人口腔情况的观察主要通过拍摄CT、CBCT等手段,但是在进行术前术后的CT拍摄时,其…

Massive MIMO简介

目录 1、 MIMO 2、Massive MIMO 3、Massive MIMO,与 distributed Massive MIMO有什么区别? 4、分布式Massive MIMO 4.1 Distributed MIMO 4.2分布式MIMO派生出无蜂窝组网架构,和传统的蜂窝系统对比 5、小结 1、 MIMO 多输入多输出&#xff…

【论文阅读】MIMICS: A Large-Scale Data Collection for Search Clarification

文章目录 MotivationIntroContributionMIMICS-ClickMIMICS-ClickExploreMIMICS-ManualData AnalysisQuestion Template AnalysisAnalyzing Engagement Based on Clarification ImpressionAnalysis Based on Query LengthAnalysis Based on the Number of Candidate AnswersAnal…

使用mimics重建CT图像

1.打开CT图像文件 2.界面左边为CT图像的3个视图,右边三个区域分别是 掩模 3D对象 和多边形 3.用 1选择其中一个视图 2选取骨头阈值 3区域生长选取一个掩模 4对掩模进行编辑,添加消除 5.生成三维线条 我们生成一个3维骨骼模型说明用法 4.对比度选择soft…

【Mimics】口腔牙齿三维重建

前提:我并非医学相关专业,应用软件也非专业的,过程结果都仅供参考 mimics21.0 空格键 放大视窗 ctrl右键上拉 ct视图放大 segment->threshold 区域增长消除噪点 单击牙齿 黄色模型为与牙齿相邻处 裁切框选 下拉选框 提取单颗牙齿分别…

Mimics: Edit mask in 3D

Mimics21.0 操作技巧 MaskEdit mask in 3D Objects使用3-matic编辑几何将3-matic编辑过的模型导入mimics Mask Edit mask in 3D 20.0以及21.0版本的mimics没有Edit mask in 3D这个菜单栏,所以我们要: VIEW --> Visualization options–> Mask 3D…

Mimics医学建模学习笔记

也是前不久开始学习CT三维建模,找了好些建模方法,后来还是采用了Mimics软件平台进行CT三维建模。以下分享下用到的一些资料。 mimics 16软件压缩包及安装方法百度云: 链接:https://pan.baidu.com/s/1hFIrdBfRE-VbFV3oGqW26Q …

Mimics:快捷键介绍

Mimics 软件介绍 mimics界面翻译mimics快捷键2D窗格:编辑图层(Edit Masks)3D窗格:观察几何(3D Objects) mimics界面翻译 mimics快捷键 视图快捷键 操作快捷方式1快捷方式2适用窗格平移Shift按住鼠标右键移…

Mimics 21.0 安装

文章目录 Mimics 21.0安装教程安装前准备主程序安装Mimics3-matic汉化教程 功能介绍模块介绍基础模块可选模块 软件优势比利时 Materialise 公司介绍 Mimics 21.0 安装教程 安装前准备 1.首先下载安装文件。 2.下载文件后解压文件,在网盘下载的要把几个分卷一起…

Mimics 21安装

Mimics 21破解版是一款非常专业的交互式的医学影像控制系统,全称为“Materialises interactive medical image control system”,是全球领先的致力于快速成型领域的开发与研究的Materialise公司发明的一种医学影像控制系统,是模块化结构的软件…

Mimics 21.0软件学习笔记(一)基本操作

Materialise Mimics Medical 21.0 打开工程窗口化Thresholding 二值化Region growing区域增长创建一个3D表示,并显示股骨头从髋臼中区分出来,并单独为股骨头建立3D模型 CT图像的形态学操作STL过程 STL 生成 打开工程 Opening the Project窗口化 Windowin…

Mimics-基础操作教程-2

本篇主要介绍 MIMICS 中的 VIEW 菜单各项功能。 Camera 各选项功能介绍 1. Rotate选项: 旋转功能 Rotate 旋转功能只能在三维模型视图上使用,有以下几种不同的方法来实现旋转功能。 a. 使用用鼠标右键拖动; b. 使用箭头键进行精确旋转…

Mimics-基础操作教程-1

1. Mimics简介(Mimics21) Mimics---是一种交互式医学图像处理软件,是一个连接二维图像数据(CT, MRI, 工业扫描数据)和三维工程学应用的图像处理工具。应用领域包括:解剖学测量、三维分析、有限元分析(FEA)、客制化植入体或装置设…

dcl java_Java内存模型之从JVM角度分析DCL

DCL,即Double Check Lock,中卫双重检查锁定。其实DCL很多人在单例模式中用过,LZ面试人的时候也要他们写过,但是有很多人都会写错。他们为什么会写错呢?其错误根源在哪里?有什么解决方案?下面就随…

java dcl_【Java并发(七)】--java内存模型之DCL

如未作特殊说明,本文均为原创,转发请注明出处 [TOC] 前言 ​ 提到双重检查锁(Double-Checked Locking)通常简称为DCL,肯定很多人第一时间想到的就是单例模式。 ​ 单例模式通常有两种方式:饿汉与懒汉模式。那么懒汉模式采用了延迟…

java 单例 dcl_DCL单例到底需不需要volatile修饰

我们先来回答这个问题 DCL单例一定需要volatile修饰。 volatile有两个功能 内存可见 防止指令冲排序 这里主要考察volatile第二个功能。在介绍为什么DCL单例一定需要volatile修饰之前,我们先来看一下DCL单例和类实例化过程。 DCL单例 public class SingleExample { …