微基生物提供宏基因组测序分析服务。
宏基因组是指特定环境中全部微生物遗传物质的总和。宏基因组测序以特定环境中的整个微生物群落作为研究的对象，不需对微生物进行分离培养，而是提取环境微生物总DNA进行研究。其摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制，在基因组水平解读微生物群体的多样性和丰度，探索微生物与环境及宿主之间的关系。
目前，第二代高通量测序技术在宏基因组的研究上已被广泛应用。第二代高通量测序平台具有通量高、准确性高、速度快、信息全等特点，加快了宏基因组测序在鉴定低丰度的微生物群落，挖掘更多基因资源方面的应用。
检测平台
- 二代高通量平台：Illumina、BGI、 Ion PGM；
- 三代高通量平台：PacBio；Nanopore
技术路线
结果展示
微生物的多样性与相对丰度
eggNOG功能注释
KEGG代谢通路
文献解读
标题：Distinct composition and metabolic functions of human gut microbiota are associated with cachexia in lung cancer patients
肺癌患者肠道菌群的独特组成及代谢功能与恶病质有关
ISME Journal (IF:9.18)
主要结果：
在31名肺癌患者中，非恶病质与恶病质组（n=12）患者在肠道菌群组成、宏基因组功能通路和相关血浆代谢物方面存在显著差异。
恶病质患者血浆中支链氨基酸、甲基组胺和维生素存在显著消耗，相关肠道菌群功能通路的也存在损耗，恶病质患者肠道菌群的脂多糖生物合成能力显著升高。癌症恶病质引起的肠道菌群功能变化。非恶病质患者中支链氨基酸和3-氧代草酸的富集分别与肠道普氏杆菌和加氏乳杆菌正相关
参考文献：Ni, Y., Lohinai, Z., Heshiki, Y. et al. Distinct composition and metabolic functions of human gut microbiota are associated with cachexia in lung cancer patients. ISME J (2021).
