1.首先打开要裁剪的图像：file->open image file
2.找到ROI工具，在快捷栏中直接找到roi工具，单击；或者通过File—new—Region of Interest。

3.描出感兴趣区域，在Region of interest (ROI) Tool面板中，选择File-> Save as，保存绘制的多边形ROI，选择保存的路径和文件名。

4.在右边Toolbox搜索框中搜subset,下面会出现SubsetData from ROIs,双击，在出现的框中选择你要裁剪的文件名，点击OK。


5.在Subset Data from ROIs Parameters面板中，设置以下参数：
Select Input ROIs：选择刚才生成的矢量文件roi
Mask pixels output of ROI？： Yes
Mask Background Value背景值：0
选择输出路径和文件名，单击OK执行图像裁剪。