VBM后的配对t检验以及xjview使用

article/2025/10/16 0:23:22

之前写了VBM后的双样本t检验,再记录一下配对t检验。
配对t检验和双样本t检验的过程基本一致。包括以下三个步骤。
第一步输入两组被试时,应该成对输入,共有几个被试就有几个pair。

在这里插入图片描述
但是这里我在做的过程中没有加协变量,不知道会不会有很大的影响。后面再重新做了看看。
接下来的第二步estimate和第三步的contrast manager都与双样本t检验一样。
因为上一篇双样本t检验和配对t检验都提到了xjview,这里也一起记录一下xjview使用过程中的步骤。
首先xjview的安装啥的就不写了,安装好添加到路径后就可以使用。
在matlab里输入xjview就可以打开了,打开后如下图。
在这里插入图片描述

然后点击上面的file选项,打开之前双样本T检验或者配对T检验得到的图,即spm_0001.nii,如下图。
在这里插入图片描述

我们可以看到xjview有很多选项,我用到了以下几个:
1.FDR校正:一般选择p=0.05,但是注意,FDR only works on positive or negative direction, not both.所以这里要先选择only +或者only -。
2.FWE校正:和FDR使用方法一样,但是FWE更严格,可以自行选择。
3.cluster size:这里可以选择体素簇大小,选择20,30等等。输入20再回车确定就可以了。
4.xjview最重要的功能 report
这里我查了一些资料,感觉是首先你要选择一个合适的cluster size,太大了会失去很多激活脑区,太小又可能会激活脑区太多。
选好之后报告,在matlab界面得到报告出的脑区
在这里插入图片描述

这里我们可以看到其实一个体素簇里面是由很多脑区组成的,一些脑区不具有特殊意义可以不报告,因此我们在写文章的时候,首先可以报告peak点所在的脑区,Cingulum_Mid_R,还可以报告体素数量比较多的脑区,例如Frontal_Sup_Mid_R,报告的时候要写清楚坐标(7.5 31.5 31.5),还有体素的数量 120,以及T值即-7.0625。


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